Estudos in silico e in vitro para busca de potenciais fármacos contra o SARS-CoV-2 (COVID-19)
O vírus SARS-CoV-2 pertence ao gênero Betacoronavírus, subgênero sarbecoronavirus, junto com outros vírus que causam a Síndrome Respiratória Aguda Grave Relacionada a Coronavírus (SARS-CoVs). Desde o mês de março de 2020 o COVID-19 vem se espalhando rapidamente no Brasil e outros países de dimensões continentais, devido principalmente à transmissão furtiva. Esforços para a busca de vacinas e drogas efetivas contra esse vírus vêm sendo desprendidos por universidades e centros de pesquisa de todo o mundo, porém ainda não se chegou a uma profilaxia ou tratamento potencialmente eficiente e seguro. A utilização de ferramentas computacionais são amplamente utilizadas nas pesquisas em novos fármacos direcionando o uso de determinados compostos químicos, já que estas permitem realizar a triagem de milhões de compostos químicos por vez diretamente nos alvos de interesse, de forma rápida, com baixo custo, e permitindo a seleção de moléculas com maior potencial para testes in vitro, e consequentemente com maior chance de sucesso no tratamento da doença. Visando buscar soluções a curto, médio e longo prazo para o combate ao SARS-CoV-2, o objetivo dessa proposta é identificar compostos com atividades antivirais, para o tratamento da COVID-19, utilizando técnicas e ferramentas da Bioinformática e Biologia Molecular, além de realizar testes in vitro contra esse vírus. Como produtos potenciais esperamos obter moléculas com atividade antiviral in vitro para COVID-19, além da possibilidade de modificação estrutural dessas moléculas, abrindo caminho para desenvolvimento de patentes. Outros produtos serão algoritmos computacionais que poderão ser aplicados em diversos outros estudos futuros com antivirais especificamente para o grupo do SARS-CoV-2.
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TRIAGEM INVERSA IN SILICO DE COMPOSTOS NATURAIS DO SEMI-ÁRIDO BAIANO, COM POTENCIAL FARMACOLÓGICO
Várias plantas do semiárido baiano vêm sendo estudadas nos últimos anos, na tentativa de encontrar novos alvos terapêuticos para uma diversidade de patologias. No entanto, apesar de vários esforços, pouco ainda se sabe quanto ao respectivo mecanismo de ação dos seus princípios ativos, ou seja, pouco se conhece onde os compostos naturais atuam no organismo. Vários ensaios biológicos in vivo e in vitro seriam necessários para elucidar esta questão, acarretando um grande custo operacional. Nos últimos anos, houve o surgimento de vários projetos genomas elucidando vários receptores farmacológicos. Esses receptores, complexados com ligantes, são depositados em um banco de dados de acesso livre, denominado Protein Data Bank (PDB). Paralelamente ao desenvolvimento de projetos genomas, a química computacional vem se desenvolvendo propondo soluções rápidas e de baixo custo para problemas envolvendo questões químicas e biológicas. Assim, o presente projeto propõe o emprego de técnicas de quimioinformática, para encontrar receptores farmacológicos (proteínas), depositados no PDB, de produtos naturais oriundos do Semi-árido baiano.
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BUSCA E DESENVOLVIMENTO DE POSSÍVEIS INIBIDORES DE PROTEÍNAS-CHAVE DO METABOLISMO DE Aedes (STEGOMYIA) aegypti L.,A PARTIR DE COMPOSTOS QUÍMICOS NATURAIS E SINTÉTICOS
O mosquito Aedes aegypti é uma espécie ocorrente em todo Brasil, principalmente associado à transmissão do vírus da Dengue, mas que nos últimos anos vem trazendo uma maior preocupação pela transmissão do Zika vírus e da Febre Chikungunya. A indústria farmacêutica tem investido na prospecção de novos compostos ativos contra A. aegypti, recorrendo à busca de substâncias autênticas na biodiversidade, bem como, na aplicação de ferramentas computacionais, usando programas de química medicinal para investigar e desenvolver possíveis inibidores de proteínas importantes da das rotas metabólicas do mosquito. A metodologia para avaliar e quantificar as moléculas que possam se complexar com as proteínas alvo é baseada na ancoragem molecular (docking), com a qual é possível testar a capacidade de interação das proteínas do mosquito com os mais diversos tipos de compostos químicos, através de simulações computacionais. Após a conclusão do genoma de A. aegypti, muitas estruturas proteicas envolvidas com o metabolismo do mosquito foram depositadas no Protein Data Bank. Nesse projeto, vamos utilizar compostos químicos disponíveis em bancos de dados públicos (PubChem, ChEMBL e ZINC) para a busca de moléculas candidatas à inibidores desses alvos.
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